Boipeba conta com ótimos meios de hospedagem, porém, o que mais combina com o destino é a simplicidade. Não pense em encontrar grandes resorts e hotéis de luxo. Com poucas exceções, em Boipeba você achará pousadas pequenas, mas que atendem bem a demanda local.
A parte em que se concentra a maioria das pousadas em Boipeba é o povoado de Velha Boipeba. Pelas ruas do povoado existem várias pousadas com um bom padrão de conforto e preços econômicos.
Hospedar-se nesta parte da ilha é uma ótima escolha, já que é neste ponto que está a maior parte dos restaurantes, o comércio em geral e o acesso para a praia da Boca da Barra é feito em menos de 10 minutos.
Dentre as pousadas localizadas no povoado de Velha Boipeba estão: Rydayam, Pousada Sete, Pousada Janaína, Sossego, Alma Viva, Pousada da Vila, Casa Verde, Pousada Tropical, entre outras.
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ara quem preferir ficar hospedado de frente para a praia, há algumas alternativas de pousadas que estão situadas em frente as praias da Boca da Barra, Tassimirim e Outeiro, como as pousadas Luar das Àguas, Vila Sereia, Santa Clara, Horizonte Azul, Tassimirim, Pouso da Maré, Outeiro, Dendê Loft, Marina de Boipeba e a charmosa Mangabeiras, localizada no alto do morro em Tassimirim.
Ainda existem outras alternativas de hospedagens em locais mais isolados e em meio a natureza exuberante de Boipeba.
É o caso da Pousada Boipeba Eco Lodge situada na Ilha de São Miguel (em frente a Boca da Barra).
Vale ressaltar também a encantadora Pousada Anjali, que está dentro da mata nativa, próxima a Praia da Boca da Barra.